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医学数据挖掘精品课程,GEO、TCGA、Oncomine数据库

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Time:2021-08-05

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方式:百度网盘观看下载

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医学教学培训课程视频讲座简介:

医学数据挖掘精品课程,GEO、TCGA、Oncomine数据库

158资源整合网:医学数据挖掘精品课程,GEO、TCGA、Oncomine数据库 培训课程视频内容介绍:

本系列课程将以视频的方式跟大家一起交流数据挖掘的神奇之处,用R软件和perl带大家玩转基因数据,从最简单的数据下载到最后我们绘制一张5年生存率,这桌饕餮盛宴,一定符合大家的口味。

目前市面上较少有系统的数据挖掘方面的视频,很多资料也是零零散散,我们将其进行整理,按照挖掘的一般流程跟大家进行讲解,整个思路将会非常清晰。

现在分析基因数据的软件非常多,有些有文献支持,有些有点山寨、对于很多初学者其实非常不容易选择。我们不仅会在第二讲中会讲GEO的一些在线工具,更多地我们选择目前最常用,也是最经典的两种编程软件,R和PERL跟大家进行讲解。这两种软件也是目前功能非常最为强大的编程工具,几乎可以解决数据挖掘方面的绝大部分操作。其中用R软件做出的可视化效果非常好,不是一般普通软件可以替代,而且可以进行不断加工和优化。其次,编程的代码已经帮大家整理好,大家并不需要担心自己不会编程,只要照着视频做,一般不会有太大问题。我们也会在群里跟大家陆续分享一些R的学习视频,供大家学习。

我们“医学方”设有讨论群,群里的同志们也是卧虎藏龙,很多操作上的问题可以及时在群里进行讨论,达到事半功倍的效果。

另外我们的豪斯医生会继续通过“医学方”的公众平台向大家推送关于数据挖掘方面的文章,学有余力的学员可以在视频的基础上继续挖深。

现在数据库有很多,我们这次课程主要选择了GEO和TCGA,分别是当前最全面的数据库和最大的肿瘤数据库,掌握这两个数据库,可以帮助大家解决科研方面很多问题。

最后一点,我们此次的教学目的很简单,不提倡走马观花地学习各种数据库,而是踏踏实实将这两个重要的数据库的操作讲解给大家听。我们保证这套视频都是实实在在的干货,只讲学员最为关心的内容,不会穿插与课程不相关的内容。

医学数据挖掘精品课程,GEO、TCGA、Oncomine数据库 课程内容目录:

1、数据挖掘概述
2、GEO在线工具的应用
3、GEO数据下载和数据质量分析
4、原始数据预处理
5、寻找差异基因及制作热图和火山图
6、G○富集分析
7、KEGG分析
8、蛋白互作网络
9、TCGA数据下载
10、TCGA数据整理和基因注释
11、寻找差异基因和制作5年生存率.
12、Oncomine概述及Meta分析
13、Oncomine之差异分析及共表达分析

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